La disinfestazione mosche si effettua quando alcune specie diventano potenzialmente pericolose per evitare la contaminazione degli alimenti nelle industrie alimentari e in tutta la filiera del settore alimentare e in tutti gli altri ambienti privati o pubblici, come le case, gli uffici, le attività commerciali come bar, ristoranti, supermercati e alberghi. Le mosche sono sempre degli insetti veicoli di malattie più o meno gravi (es. Salmonella).
Si consiglia di redigere dei piani di monitoraggio e di intervento per prevenire la presenza di questi insetti e mantenere bassa la loro presenza.
Delle migliaia specie di mosche presenti in natura, solo alcune possono essere considerate parassiti delle case o degli ambienti civili. Le specie più diffuse, per le quali è necessaria una disinfestazione, sono:


